تساعد بكتيريا الأمعاء الصحية على تقوية جهاز المناعة، والتصدى لمسببات المرض، كما أنها تعمل على تنشيط عملية الهضم وإنتاج الفيتامينات.
وحسب الجمعية الألمانية للتغذية يمكن الحفاظ على صحة بكتيريا الأمعاء المعروفة أيضا باسم "فلورا الأمعاء" من خلال التغذية الصحية، مثل الأطعمة المحتوية على حمض اللاكتيك كمنتجات الألبان (اللبن والزبادى) والأطعمة الغنية بالألياف الغذائية مثل منتجات الحبوب الكاملة والخضروات (الخرشوف) ورقائق الشوفان وبذور الكتان.
كما يحظى التفاح بأهمية كبيرة لصحة الأمعاء؛ وذلك لاحتوائه على مادة البكتين، التى تعمل على زيادة أعداد بكتيريا الأمعاء، وللاستفادة من التفاح ينبغى تناوله بالقشرة، نظرا لوجود مادة البكتين بها.
وبالإضافة إلى ذلك، تعتبر الخميرة مهمة لصحة الأمعاء، كونها تندرج ضمن ما يعرف "بالمعززات الحيوية" أو "البروبيوتيك"، والتى تعمل على محاربة سلالات الفطريات، التى يمكن أن تسبب المرض من ناحية، وتساعد على نمو الفطريات، التى لها تأثير إيجابى على نشاط الأمعاء من ناحية أخرى.
