شن عدد من علماء الأزهر هجوماً حاداً على مؤسسى قناة «العقل الحر»، وقال العلماء إن مؤسسيها «ملحدون ويتطاولون على الدين الإسلامى»، وطالبوا الرئيس عبدالفتاح السيسى بدعوة هؤلاء الملحدين للتوبة، وإذا لم يرجعوا عن مواقفهم فعليه ضرب رقابهم فى ميدان عام، وإسقاط الجنسية عنهم، فيما رد أحد مؤسسى القناة على تلك الدعوات بالقول: «كفوا عن مناطحة طواحين الهواء».

وقال الدكتور محمود مهنا، عضو هيئة كبار علماء الأزهر: «أطالب الرئيس عبدالفتاح السيسى بدعوة الملحدين للتوبة، وإذا لم يستجيبوا يسجنهم، وإذا لم يرجعوا عن موقفهم فعليه ضرب رقابهم فى ميدان عام حتى يكونوا عبرة لغيرهم»، وأضاف أن «السيسى هو المسئول عن الحفاظ على الإسلام ومن حقه وقف أى شىء يضر بثوابت الدين ويجب إسقاط الجنسية على من لا يحترم الأديان السماوية»، مشيراً إلى أن مؤسسة الأزهر ستصعِّد الأمر لمنع إنشاء القناة.

وقال الدكتور أحمد زكى، أحد علماء الأزهر الشريف: «الملحدون يقولون ما يشاءون، فليس بعد الكفر ذنب، وحماية الإسلام مسئولية ولاة الأمر والأزهر، وبعدها يأتى دور العلماء والدعاة»، وأكد أنهم سيتصدون لهذه القناة، قائلاً: «لا يجوز إنشاء قناة تنشر الإلحاد فى بلد مسلم، والملحدون يعتبرون أنفسهم أعداءً لأمة بأكملها، ويشنون حرباً نفسية ضد الوطن، وهى أقوى من الحرب العسكرية». وقال الدكتور طارق السهرى، رئيس الهيئة العليا لحزب النور السلفى: «هذه الدعوات تأتى من زنادقة أصحاب عقول مغيَّبة لا تفهم طبيعة الدين ولا تؤمن بوجود إله». فى المقابل، هاجم أحمد حرقان، مؤسس قناة «العقل الحر»، عبر صفحته على موقع «فيس بوك»، رجال الأزهر والسلفيين قائلاً: «رسالة مخلصة للأزهر وللدعوة السلفية، أنتم لا تملكون الأثير، لذلك كفوا عن مناطحة طواحين الهواء، فالعالم أصبح قرية صغيرة جداً».